我们的方法
为了将针对TBXT基因的靶向治疗带给脊索瘤患者，Chordoma Foundation正积极通过以下方式，推动、降低风险并加速TBXT药物发现与研发过程的每个阶段：
资助关于TBXT基因功能的基础研究
开发共享的研究支持资源、工具和数据集
通过Chordoma Foundation Labs提供一系列发现生物学和转化研究能力
与企业及研究人员合作，推动高效药物研发
照片: CF Labs scientist Nindo Punturi
通力合作
依托我们的实验室能力，我们致力于与企业及研究人员开展合作，推动针对TBXT基因的分子药物在各个研发阶段取得进展。
我们将根据每个项目的具体需求提供量身定制的支持。
欢迎您联系我们的团队，共同探讨如何结合您的独特专业知识和研究兴趣，共同推进针对TBXT基因的药物研发。
命中识别与验证
我们提供高通量检测/测定服务，用于识别针对TBXT基因的分子并评估其潜力。我们的目标是降低针对TBXT基因进行靶向研究的准入门槛，并助力快速做出是否继续推进的决策。
点击转线索优化
我们可以支持迭代的检测/测定循环，以促进针对TBXT基因的化合物的进一步优化，从而筛选出先导化合物。
潜在客户优化及其延伸
我们有意建立合作伙伴关系，以推动候选药物通过先导化合物优化、临床前的开发，并最终完成新药临床试验申请（IND）提交及临床开发。
可用资源
纯化TBXT基因蛋白
在大肠杆菌中表达的重组TBXT基因（全长蛋白或分离出的DNA结合域），经亲和色谱和凝胶过滤色谱纯化
全长TBXT基因（C端带AviTag）
DNA结合域纯化（操作指南链接）
细胞增殖检测
CellTiter-Glo增殖检测/测定（操作指南链接）
我们在结构基因组学联盟（SGC）的合作伙伴已生成以下与 TBXT 药物发现相关的开放获取数据集：
TBXT基因SGC TEP
TBXT基因 DNA结合域（与DNA结合的晶体结构）
临床前的脊索瘤模型
我们已汇集了一系列经过验证且表征详尽的脊索瘤细胞系、CDX和PDX模型，这些资源均可在我们的资源库中获取。点击此处了解更多。
照片: CF Labs team member Caitlin King
可用功能
工程化细胞系
- 我们对脊索瘤及其他TBXT基因阳性细胞系进行了基因工程改造，使其表达一种多西环素诱导型TBXT shRNA。 通过Western blot、免疫荧光和/或RT-PCR验证了TBXT基因的可诱导敲低。这些细胞系还恒定表达GFP。通过与CF Labs合作，可提供以下工程化细胞系：
- U-CH1（脊索瘤）TBXT基因shRNA
- H460（非小细胞肺癌）TBXT基因shRNA
- SW480（结直肠癌）TBXT基因shRNA
结合与结构检测/测定
表面等离子体共振（SPR）：我们使用 Biacore 8K SPR 系统来筛选 TBXT 配体。将纯化的生物素标记 TBXT 固定在链霉亲和素包被的传感器芯片上，并通过稳态亲和力测定化合物与 TBXT 的结合情况。 您可在此处进一步了解我们的实验方案。
生物分子核磁共振（即将推出）
晶体学（即将推出）
结构生物信息学（即将推出）
功能检测
基因报告基因检测/测定，用于评估TBXT基因转录活性的抑制情况。我们通过基因工程改造了H460细胞，使其在TBXT响应元件下游表达GFP，并可通过荧光板阅读器监测GFP水平，从而以高通量方式评估TBXT基因的抑制作用。
qRT-PCR用于测定TBXT基因（包括TBXT、YAP1和KRT8）的表达水平
异种移植疗效研究
作用机制研究
DNA结合抑制（电泳迁移率位移检测/DNA凝胶位移检测方案）
TBXT基因降解与拯救检测/测定
为什么选择TBXT基因？
TBXT基因的表达是脊索瘤几乎普遍存在的标志性特征。这种转录因子是胚胎脊索发育的关键调节因子，越来越多的证据表明，它是脊索瘤的主调控因子，且对肿瘤生长必不可少。 值得注意的是，功能基因组学研究已将 TBXT基因确定为脊索瘤细胞中的关键遗传必需基因。此外，该基因在健康成人组织中的表达水平极低，这使其成为极具吸引力的治疗靶点。
除了脊索瘤之外，TBXT基因还与肺癌、结肠癌、乳腺癌和前列腺癌等多种其他癌症的肿瘤进展、治疗耐药性以及不良预后相关。
这凸显了TBXT基因作为药物靶点的潜在价值，其相关性远不止于脊索瘤。
照片: Late chordoma patient Dimitrios visited our lab with his father, Theodore
与我们互动
如果您是希望探索TBXT基因作为治疗靶点的企业或研究人员，我们欢迎您与我们联系，进一步了解我们如何支持您的工作。
此外，如果您是资助方或捐赠者，致力于在对抗脊索瘤以及其他与TBXT基因相关的癌症（如肺癌、结肠癌、乳腺癌和前列腺癌）的斗争中产生深远影响，我们诚挚邀请您考虑为这项工作提供资助。